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Cytogène : Cytogénomique Structurale et fonctionnelle

Equipe CYTOGENE: Cytogénomique Structurale et fonctionnelle

 

L’équipe « Cytogénomique Structurale et fonctionnelle » (Cytogene) étudie, chez les animaux d’élevage, le lien entre la structuration du génome autour des chromosomes et sa transmission entre cellules ou entre individus. Elle étudie aussi comment cette structuration influe sur le fonctionnement du génome. Enfin, cette équipe, forte de son expertise en cytogénétique structurale, possède une plateforme de contrôle chromosomique des populations d’élevage afin de prévenir l’hypofertilité des reproducteurs (porcs et bovins essentiellement).

Les thématiques sont les suivantes :

1. Architecture nucléaire 3D, interactions chromatiniennes et expression génique

2. Impact des variants de structure sur l’organisation fonctionnelle des génomes

3. Génomique et caractérisation de la diversité génétique des populations d’abeilles.

 

Barasc H, Mouney-Bonnet N, Peigney C, Calgaro A, Revel C, Mary N, Ducos A, Pinton A. 2018. Analysis of Meiotic Segregation Pattern and Interchromosomal Effects in a Bull Heterozygous for a 3/16 Robertsonian Translocation. Cytogenet Genome Res. 156(4):197-203

Marti-Marimon, M., N. Vialaneix, V. Voillet, M. Yerle-Bouissou, Y. Lahbib-Mansais, and L. Liaubet. 2018. A new approach of gene co-expression network inference reveals significant biological processes involved in porcine muscle development in late gestation, Scientific Reports, 8:10150

Wragg, D., M.A. Técher, K. Canale-Tabet, B. Basso, J.P. Bidanel, E. Labarthe, O. Bouchez, Y. Le Conte, J. Clémencet, H. Delatte, and A. Vignal. 2018. Autosomal and mitochondrial adaptation following admixture: a case study on the honey bees of Reunion Island, Genome Biology and Evolution, 10: 220-38

Mary, N., H. Barasc, S. Ferchaud, A. Priet, A. Calgaro, A.M. Loustau-Dudez, N. Bonnet, M. Yerle, A. Ducos, and A. Pinton. 2016. Meiotic Recombination Analyses in Pigs Carrying Different Balanced Structural Chromosomal Rearrangements, Plos One, 11: Apr 28;11(4):e0154635

Lahbib-Mansais Y, Barasc H, Marti-Marimon M, Mompart F, Iannuccelli E, Robelin D, Riquet J, Yerle-Bouissou M. 2016. Expressed alleles of imprinted IGF2, DLK1 and MEG3 colocalize in 3D-preserved nuclei of porcine fetal cells. BMC Cell Biol 17(1):35.

 

13 agents permanents (*Agents basés sur le site de l’ENVT)

Scientifiques : M. Bouissou-Matet (DR, INRA), A. Vignal (DR, INRA)

ITA : H. Barasc* (IE, ENVT), A. Calgaro* (AI, ENVT), S. Camut (AI, INRA), K. Canale-Tabet (IE, INRA), E. Labarthe (TR, INRA), Y. Lahbib (IR, INRA), C. Marrauld (TR, INRA),  N. Mary* (AI, INRA), N. Mouney* (TR, ENVT), A. Pinton* (IR, INRA).

 

Alain Pinton, animateur d’équipe : alain.pinton@envt.fr

Alain Pinton, directeur de la plateforme de contrôle chromosomique : alain.pinton@envt.fr, labocyto@envt.fr

 

Lien vers le site propre de l’unité de recherche : http://genphyse.toulouse.inra.fr/